ワイリーステージを守るボス達はインパクト大！
メカドラゴン
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ピコピコくん
ワイリーステージ2のボス。元々はDr.ライト宅のガードシステムであったのを、ワイリーが対ロックマン用に改造したもの。ワイリーは過去ライトの研究所に忍び込んだ際、これに酷い目に遭わされたらしい。
壁と床のブロックが分離・合体し、体当たりすることで戦闘力を発揮する。1体が破壊されると次のブロックが合体し、最大14体出現する。
壁と床のブロックが分離・合体し、体当たりすることで戦闘力を発揮する。1体が破壊されると次のブロックが合体し、最大14体出現する。
ガッツタンク
ワイリーステージ3のボス。前作で登場したガッツマンをベースに開発された、超大型戦車。
エネルギー弾での攻撃の他、ネオメットールを射出してくる。その重量は相当のものであるが、その実、重さを多く占めるのは積んである燃料であり、それほどに燃費が悪い。
よく見ると後部のタンクに「LPガス」の文字を確認できる。
エネルギー弾での攻撃の他、ネオメットールを射出してくる。その重量は相当のものであるが、その実、重さを多く占めるのは積んである燃料であり、それほどに燃費が悪い。
よく見ると後部のタンクに「LPガス」の文字を確認できる。
ブービームトラップ
ワイリーステージ4のボス。硬化フードによって守られたビーム発射装置。
その防御力は半端ではなく、弱点武器以外の攻撃は一切受け付けない。部屋の各箇所に5基配備されている。一定間隔で砲台が赤く光り、ロックマンに向けて弾が発射される。弾の速度はかなり速く、避けるのが非常に困難である。
攻略にパズル要素が含まれており、ボスの部屋にはクラッシュボムでしか破壊できない壁が配置されているため、どの箇所を破壊するかよく考えないと途中で武器エネルギーが切れてしまい、どうやってもボスを倒せなくなるという事態に陥る。ただし再戦時には前回破壊した壁はそのままの状態のため、ハマリにはならない仕様となっている（ゲームオーバー時には元通りになる）。
その防御力は半端ではなく、弱点武器以外の攻撃は一切受け付けない。部屋の各箇所に5基配備されている。一定間隔で砲台が赤く光り、ロックマンに向けて弾が発射される。弾の速度はかなり速く、避けるのが非常に困難である。
攻略にパズル要素が含まれており、ボスの部屋にはクラッシュボムでしか破壊できない壁が配置されているため、どの箇所を破壊するかよく考えないと途中で武器エネルギーが切れてしまい、どうやってもボスを倒せなくなるという事態に陥る。ただし再戦時には前回破壊した壁はそのままの状態のため、ハマリにはならない仕様となっている（ゲームオーバー時には元通りになる）。
エイリアン
最終ステージのボス。Dr.ワイリーの真の姿と思いきや、ホログラフ投影装置によって映し出された宇宙人。姿形は「200X年度版 よい子の怪物図鑑」を参考に作られている。
「∞」の軌道を描きながら浮遊移動し、一定間隔で弾を撃ってくる。ある特殊武器しか通用せず、それ以外の武器を当てるとエネルギーを全回復させてしまうため、残存武器エネルギー量によってはゲームオーバーになってコンティニューするしか攻略の手立てがない。また攻撃力も非常に高く、接触してしまうとかなりのダメージを負う。『Dr.ワイリーの謎』というサブタイトルの由来はこのエイリアンの存在にある。
「∞」の軌道を描きながら浮遊移動し、一定間隔で弾を撃ってくる。ある特殊武器しか通用せず、それ以外の武器を当てるとエネルギーを全回復させてしまうため、残存武器エネルギー量によってはゲームオーバーになってコンティニューするしか攻略の手立てがない。また攻撃力も非常に高く、接触してしまうとかなりのダメージを負う。『Dr.ワイリーの謎』というサブタイトルの由来はこのエイリアンの存在にある。
選べる８ステージの概要
メタルマンステージ
多くのプレイヤーが最初に選ぶであろうボス、メタルマン。
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スタート位置
工場を思わせるステージ。至る所にあるベルトコンベアーが特徴。
両端に表示している矢印方向に流される仕組みになっている。
工場を思わせるステージ。至る所にあるベルトコンベアーが特徴。
両端に表示している矢印方向に流される仕組みになっている。
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ロックマン２から初出となる、エネルギー缶。
４つまで所持する事ができるが、ゲームオーバー後にコンティニューをするとエネルギー缶が０になる。
ベルトコンベアーで足場が安定しない為、プレスや天井・床面から大量に湧き出るドリル型の「モール」等に苦戦する。
４つまで所持する事ができるが、ゲームオーバー後にコンティニューをするとエネルギー缶が０になる。
ベルトコンベアーで足場が安定しない為、プレスや天井・床面から大量に湧き出るドリル型の「モール」等に苦戦する。
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メタルマンは高い跳躍力を持っている事が特徴。
ジャンプ中に、メタルブレードをロックマン目掛けて１～３発投げてくる。
近づくと大ジャンプして反対側へ逃げる。
一定時間に向きが変わるベルトコンベアーが地味に厄介。
ロックバスターで、１ダメージ与える事が出来る。
弱点は、４ダメージ与えるクイックブーメラン。
ジャンプ中に、メタルブレードをロックマン目掛けて１～３発投げてくる。
近づくと大ジャンプして反対側へ逃げる。
一定時間に向きが変わるベルトコンベアーが地味に厄介。
ロックバスターで、１ダメージ与える事が出来る。
弱点は、４ダメージ与えるクイックブーメラン。
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メタルブレードは消費量１／５で、最大３連射で８方向に飛ばす事が出来る、シリーズ屈指の優秀な武器。
コスト・威力・範囲において非常に優秀なので、あらゆる場面で使う事が出来る。
コスト・威力・範囲において非常に優秀なので、あらゆる場面で使う事が出来る。
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エアーマンステージ
エアーマンは当時からプレイしていた方だけでなく、別の形でエアーマンを知った人が居るかもしれない。
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Ta_Watanabe
ワイリーステージ1の終盤ではロックマンを背後から追いかける演出があるが、この段階では無敵状態であり、スクロールが停止するまではダメージを与えることができない。このときにロックマンとドラゴンが接触すると一発アウト。また、戦う場所は足場が少なく、落下する危険性が高いので、正確な操作が要求される。
実は、もともと第1作目ロックマンで没になったボスである。当時のファミリーコンピュータではこのような巨大なキャラを激しく動かすのは処理能力の関係で困難だったため没になったのだが、「ボスを動かすのではなく、足場と背景の雲をボスに向かって動かし、ロックマンが画面右端に逃げるようにすればボスが動いているように見える」という手法を用いて登場させるに至った。